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Testes genéticos em medicina fetal: do NIPT ao exoma
Medicina Fetal 22 min de leitura

Testes genéticos em medicina fetal: do NIPT ao exoma

Dr. Rafael Bruns
Dr. Rafael Bruns MÉDICO · CRM-PR 18.582 / CRM-RS 58.559
· 22 min de leitura

Genética · Diagnóstico Pré-natal

Testes Genéticos na Gestação: o que cada exame detecta e quando é indicado

DNA livre, cariótipo, microarray, exoma — são muitos nomes e muitas siglas. Se o seu médico mencionou algum desses termos, é natural sentir-se perdida. Este artigo explica, em linguagem simples, o que cada teste genético faz, o que ele consegue e o que ele não consegue detectar — e quando cada um é indicado durante a gestação.

Imagine assim: O código genético do seu bebê é como uma biblioteca. Cada teste genético lê essa biblioteca com um nível de detalhe diferente — do número de livros nas prateleiras até cada palavra em cada página. Entender essa analogia é a chave para entender os testes.

Conteúdo informativo. Não substitui consulta médica presencial ou por telemedicina com avaliação individualizada.

O código genético é como uma biblioteca

Para entender os testes genéticos, ajuda muito pensar no DNA como uma grande biblioteca — a biblioteca que contém todas as instruções para formar e manter o corpo humano.

Nessa analogia:

  • O DNA é a biblioteca completa — todo o conjunto de informações genéticas que você herda do seu pai e da sua mãe.
  • Os cromossomos são os livros dessa biblioteca. Nós temos 46 volumes — 23 herdados do pai e 23 da mãe. Cada livro contém um grande conjunto de instruções.
  • Os genes são os capítulos dentro de cada livro. Cada gene é uma instrução específica — uma “receita” que o corpo usa para fabricar uma proteína, que por sua vez desempenha uma função no organismo.
  • As bases (A, T, C, G) são as palavras que formam o texto de cada capítulo. São apenas quatro letras, mas combinadas em sequências longuíssimas, elas escrevem todas as receitas do corpo.

Agora, cada teste genético olha para essa biblioteca com um nível de zoom diferente:

  • NIPT: olha de fora da biblioteca, pela janela, e conta quantos exemplares de alguns livros existem na prateleira.
  • Cariótipo: entra na biblioteca, conta os 46 livros, verifica se estão todos lá e na ordem certa.
  • Microarray: abre cada livro e verifica se os capítulos têm o número certo de páginas — sem ler o texto.
  • Exoma: lê palavra por palavra os capítulos mais importantes — cerca de 2% de toda a biblioteca, mas justamente os 2% que contêm as receitas que o corpo efetivamente usa.
  • Genoma completo: lê absolutamente tudo, palavra por palavra — inclusive as partes entre os capítulos.
Importante: Nenhum teste é “melhor” que outro em absoluto. Cada um responde a uma pergunta diferente. O segredo está em saber qual pergunta fazer — e isso depende da situação clínica.

E há uma razão importante para isso: em algumas situações, o teste mais completo não é o mais indicado. Por exemplo, se o ultrassom mostra um padrão que lembra uma triploidia (quando o bebê tem 69 cromossomos em vez de 46), o cariótipo — que é o teste mais “simples” — é justamente o mais indicado, porque o microarray e o exoma podem não detectar triploidia. Por isso, a escolha do teste certo depende sempre da avaliação do especialista.

NIPT — o teste de DNA livre no sangue materno

A partir de aproximadamente 10 semanas de gestação, fragmentos do DNA do bebê — na verdade, do DNA da placenta, que é geneticamente muito semelhante ao do bebê — passam a circular no sangue da mãe. São pedacinhos muito pequenos, chamados de DNA livre (em inglês, cell-free DNA).

O NIPT (sigla em inglês para Non-Invasive Prenatal Testing, ou teste pré-natal não invasivo) é um exame de sangue da mãe que analisa esses fragmentos de DNA. É uma simples coleta de sangue — sem agulha na barriga, sem risco para o bebê.

O NIPT padrão analisa as condições cromossômicas mais comuns:

  • Trissomia do 21 (síndrome de Down) — quando há três cópias do cromossomo 21 em vez de duas
  • Trissomia do 18 (síndrome de Edwards)
  • Trissomia do 13 (síndrome de Patau)
  • Sexo do bebê (pela presença ou ausência do cromossomo Y)

A sensibilidade do NIPT para a trissomia do 21 é superior a 99% — ou seja, ele identifica corretamente a grande maioria dos casos. Mas atenção: o NIPT não é um exame diagnóstico. Ele é um rastreamento de alta performance. Se o resultado vier alterado, é necessário confirmar com um exame invasivo (amniocentese ou biópsia de vilo corial).

NIPT ampliado — o que muda?

Alguns laboratórios oferecem uma versão ampliada do NIPT, que além das trissomias analisa também as chamadas microdeleções — pequenos pedaços faltantes em cromossomos específicos. Voltando à analogia da biblioteca: imagine que um livro perdeu algumas páginas de um capítulo. O cariótipo não percebe essa falta, mas o NIPT ampliado consegue rastrear as microdeleções mais conhecidas.

As principais microdeleções rastreadas pelo NIPT ampliado incluem:

  • Síndrome de DiGeorge (deleção 22q11.2) — uma das microdeleções mais frequentes
  • Síndrome de Cri-du-chat (deleção 5p)
  • Síndromes de Prader-Willi e Angelman (deleção 15q)
  • Síndrome de Williams (deleção 7q11.23)
  • Deleção 1p36

O NIPT ampliado pode ser considerado quando há risco intermediário no rastreamento de primeiro trimestre, translucência nucal aumentada ou idade materna avançada.

Para lembrar: O NIPT — padrão ou ampliado — é um exame de sangue da mãe. Não oferece risco para o bebê. Mas é importante lembrar: ele rastreia apenas as condições para as quais foi programado. Muitas doenças genéticas ficam fora do seu alcance.

Para entender como o risco é calculado no primeiro trimestre e o que significa cada faixa, veja como interpretar o resultado do morfológico.

Cariótipo — contando os livros da biblioteca

O cariótipo é o exame genético mais antigo e mais conhecido. Na nossa analogia, ele entra na biblioteca, conta os 46 livros e verifica se estão todos completos e na ordem certa.

O que ele consegue identificar:

  • Se há um livro a mais (47 livros em vez de 46) — isso é uma trissomia, como a síndrome de Down (trissomia do 21).
  • Se falta um livro (45 livros) — isso é uma monossomia, como a síndrome de Turner (monossomia do X).
  • Se um capítulo de um livro foi parar em outro livro — isso é uma translocação, ou seja, um pedaço de cromossomo que trocou de lugar.
  • Se os capítulos estão na ordem invertida dentro de um livro — isso é uma inversão.

A resolução do cariótipo é de 5 a 10 Mb (milhões de pares de base). Em termos práticos, é um zoom “de longe” — ele enxerga alterações grandes, mas não consegue ver detalhes pequenos.

Para realizar o cariótipo, é preciso ter células vivas do bebê ou da placenta, colhidas por amniocentese ou biópsia de vilo corial. Essas células precisam ser cultivadas em laboratório para que seus cromossomos possam ser analisados, e por isso o resultado leva cerca de 14 dias.

Existe também a opção de testes rápidos (chamados MLPA ou QF-PCR), que fornecem um resultado parcial em 24 a 72 horas — analisando apenas os cromossomos mais frequentemente alterados (13, 18, 21, X e Y). Esses testes rápidos são muito úteis para dar uma primeira resposta enquanto o cariótipo completo está sendo preparado.

O que o cariótipo NÃO vê:

  • Microdeleções — pedaços faltantes menores que 5 Mb, como a síndrome de DiGeorge
  • Mutações pontuais — erros em uma única “palavra” do DNA
  • Doenças monogênicas — problemas causados por alteração em um gene específico
Você sabia? Desde 2013, o American College of Obstetricians and Gynecologists (ACOG) considera o cariótipo insuficiente como único teste para investigar malformações fetais, recomendando complementação com microarray quando o cariótipo é normal.

Microarray — verificando as páginas de cada capítulo

Se o cariótipo entra na biblioteca e conta os livros, o microarray vai além: ele abre cada livro e verifica se cada capítulo tem o número certo de páginas. Um capítulo com páginas faltando (o que os geneticistas chamam de microdeleção) ou com páginas repetidas (microduplicação) pode causar problemas — e o cariótipo simplesmente não consegue ver isso.

A resolução do microarray é de 50 a 100 kb (quilobases) — ou seja, cerca de 100 vezes mais detalhada que a do cariótipo. É como trocar uma lupa comum por um microscópio.

Outra vantagem prática: o microarray não precisa de cultura celular. Enquanto o cariótipo exige que as células sejam cultivadas durante dias, o microarray trabalha diretamente com o DNA extraído da amostra — o que pode acelerar o resultado.

Em termos de capacidade diagnóstica, o microarray detecta tudo que o cariótipo detecta (com exceção de algumas alterações específicas) e mais: as microdeleções e microduplicações que o cariótipo não enxerga.

Um estudo de referência publicado no New England Journal of Medicine em 2012 (Wapner et al.) mostrou que, em fetos com malformações e cariótipo normal, o microarray encontrou a causa genética em aproximadamente 6% dos casos a mais. Pode parecer pouco, mas para as famílias que recebem esse diagnóstico, faz toda a diferença.

O que o microarray NÃO vê:

  • Mutações pontuais — erros em uma palavra específica do DNA (para isso, é preciso o exoma)
  • Translocações balanceadas — quando pedaços de cromossomos trocam de lugar sem perda nem ganho de material (para isso, o cariótipo é necessário)
  • Triploidia — quando o bebê tem 69 cromossomos em vez de 46 (o cariótipo é mais confiável para esse diagnóstico)

Realidade brasileira

O microarray é hoje considerado o exame de escolha para investigar anomalias fetais em grande parte do mundo. No Brasil, entretanto, ele não tem cobertura obrigatória pelos convênios na maioria dos casos, o que pode ser uma barreira financeira para muitas famílias.

Uma estratégia prática que vale a pena conhecer: ao realizar uma amniocentese, o médico pode coletar o material para o cariótipo e separar uma alíquota extra de líquido amniótico para extrair e armazenar DNA. Se o cariótipo vier normal e a investigação precisar ir adiante, é possível usar esse DNA armazenado para realizar microarray ou exoma posteriormente — sem precisar de uma nova punção.

Dica importante: Guardar uma alíquota extra de líquido amniótico é uma decisão simples que pode fazer diferença no futuro. Converse com seu médico sobre essa possibilidade antes do procedimento.

Exoma — lendo palavra por palavra os capítulos mais importantes

Agora chegamos a um nível de detalhe muito maior. O exoma lê o texto propriamente dito — palavra por palavra. Mas não de toda a biblioteca: ele lê apenas os capítulos que contêm as “receitas” usadas pelo corpo para fabricar proteínas. Esses capítulos se chamam exons, e representam cerca de 2% de todo o nosso DNA.

Pode parecer pouco, mas são justamente os 2% mais importantes — porque é neles que estão as instruções que realmente fazem o organismo funcionar. A grande maioria das doenças genéticas conhecidas é causada por alterações nesses 2%.

Em termos de rendimento diagnóstico, o exoma pode identificar a causa genética em até 67-70% dos casos de malformações fetais sindrômicas — um número muito superior ao do cariótipo e do microarray quando a causa é uma doença monogênica (causada por alteração em um único gene).

Exoma trio — sequenciando pai, mãe e bebê

Quando se sequencia o DNA do bebê sozinho, podem aparecer variantes (alterações) cujo significado não fica claro: será que o bebê herdou essa variante de um dos pais? Ou ela surgiu pela primeira vez no bebê?

O exoma trio resolve essa questão ao sequenciar o DNA do bebê, da mãe e do pai simultaneamente. Isso permite identificar:

  • Variantes de novo — alterações que surgiram no bebê e não vieram de nenhum dos pais. Essas variantes são uma forte evidência de que podem ser a causa do problema.
  • Herança recessiva — situações em que cada pai carrega uma cópia alterada de um gene (sem ter sintomas) e o bebê herdou as duas cópias alteradas.

O exoma trio é a versão mais informativa do exoma e, sempre que possível, é a forma preferida de realizar o teste.

Quando o exoma faz mais diferença

Existem situações clínicas em que o exoma tem um rendimento diagnóstico particularmente alto:

  • Hidropsia fetal não imune — quando há acúmulo de líquido no corpo do bebê sem relação com incompatibilidade sanguínea. Muitas causas são genéticas, incluindo as chamadas RASopatias e erros inatos do metabolismo.
  • Displasia esquelética — problemas na formação dos ossos do bebê. A grande maioria das displasias esqueléticas é causada por alteração em um único gene.
  • Múltiplas malformações sem padrão reconhecível — quando o bebê apresenta várias alterações que não se encaixam em uma síndrome conhecida.
  • Translucência nucal muito aumentada com cariótipo e microarray normais — nesses casos, doenças como a síndrome de Noonan e outras RASopatias são causas frequentes, e só o exoma consegue identificá-las.

Saiba mais sobre a hidropsia fetal e suas causas genéticas.

Sequenciamento do genoma completo — lendo toda a biblioteca

O sequenciamento do genoma completo faz exatamente o que o nome diz: lê absolutamente tudo — todos os livros, todos os capítulos, todas as palavras, inclusive as partes que ficam entre os capítulos (chamadas de regiões não codificantes, que representam 98% do DNA).

Na teoria, é o teste mais abrangente que existe. Na prática, porém, sua aplicação clínica no pré-natal ainda é predominantemente em pesquisa. O custo é cerca de três vezes maior que o do exoma, e a quantidade de dados gerados é tão grande que a interpretação é significativamente mais complexa.

A vantagem teórica é que o genoma completo pode encontrar alterações em regiões do DNA que o exoma não cobre — incluindo regiões regulatórias (que controlam quando e como os genes são ativados). No entanto, na prática clínica atual, o exoma ainda é o teste de escolha para a investigação de doenças monogênicas no pré-natal.

Qual teste pedir? Nem sempre o mais completo é o melhor

TesteO que faz (analogia)O que detectaO que NÃO detectaPrecisa de punção?Tempo resultadoCusto relativo
NIPTOlha pela janela e conta exemplares de alguns livrosTrissomias 21, 18, 13; sexo; microdeleções (ampliado)Malformações estruturais; doenças monogênicas; maioria das anomalias cromossômicas rarasNão (sangue materno)5-10 dias úteis$$
CariótipoEntra na biblioteca e conta os 46 livrosAneuploidias; translocações; inversões; triploidiaMicrodeleções; mutações pontuais; doenças monogênicasSim (amnio ou BVC)~14 dias$
MicroarrayAbre cada livro e conta as páginas dos capítulosTudo do cariótipo + microdeleções e microduplicaçõesMutações pontuais; translocações balanceadas; triploidia (pode falhar)Sim (amnio ou BVC)7-14 dias$$
ExomaLê palavra por palavra os 2% mais importantesDoenças monogênicas; variantes pontuais nos exonsAneuploidias; triploidia; variantes em regiões não codificantesSim (amnio ou BVC)3-6 semanas$$$
Genoma completoLê absolutamente tudo, palavra por palavraTudo do exoma + regiões não codificantesInterpretação limitada em muitas regiões; uso clínico ainda restritoSim (amnio ou BVC)4-8 semanas$$$$

Para pacientes jovens, os testes moleculares importam ainda mais

Existe uma percepção comum de que testes genéticos são “coisa de gestante mais velha”. Mas essa ideia merece uma reflexão mais cuidadosa.

As aneuploidias — como a trissomia do 21 — têm relação direta com a idade materna: quanto mais velha a mãe, maior o risco. Isso é bem estabelecido. Porém, as doenças monogênicas (causadas por alteração em um gene específico) e as microdeleções não dependem da idade. Sua frequência é a mesma em uma mãe de 20 ou de 40 anos.

A consequência prática disso é relevante: em uma paciente jovem (abaixo de 28-30 anos) com um achado anormal no ultrassom, a probabilidade de a causa ser uma doença monogênica ou uma microdeleção é proporcionalmente maior do que a de ser uma aneuploidia. Nesses casos, investigar apenas com cariótipo pode ser insuficiente — o microarray e o exoma ganham importância.

O teste certo depende da pergunta certa

Vale reforçar: nem sempre o teste mais completo é o mais indicado. Alguns exemplos:

  • Suspeita de triploidia? O exoma não detecta — mas o cariótipo sim.
  • Suspeita de síndrome de DiGeorge? O cariótipo não detecta — mas o microarray sim.
  • Suspeita de síndrome de Noonan? Nem o cariótipo nem o microarray detectam — mas o exoma sim.

Por isso, a escolha do teste deve ser feita pelo especialista, considerando o quadro clínico completo: o que o ultrassom mostrou, a história familiar, a idade gestacional e o que já foi investigado.

Lembre-se: A genética está evoluindo rapidamente. Novos genes e doenças são descobertos continuamente. Por isso, além do médico que acompanha sua gestação, o acompanhamento com um médico geneticista pode ser fundamental — especialmente na interpretação de resultados complexos ou variantes de significado incerto (chamadas de VUS ou VOUS).

AVALIAÇÃO ESPECIALIZADA

Precisa de orientação sobre qual teste genético realizar?

Uma avaliação especializada ajuda a definir a investigação mais adequada para o seu caso.

Amniocentese e biópsia de vilo corial — como o material é coletado

Para realizar o cariótipo, o microarray ou o exoma, é preciso ter acesso a células do bebê ou da placenta. Isso é feito por meio de dois procedimentos:

  • Biópsia de vilo corial (BVC): coleta pequenos fragmentos da placenta. É realizada entre 11 e 14 semanas de gestação.
  • Amniocentese: coleta líquido amniótico — o líquido que envolve o bebê e que contém células que se desprenderam da pele e de outros tecidos fetais. É realizada a partir de 15 semanas.

Ambos os procedimentos são guiados por ultrassom em tempo real e realizados com uma agulha fina. O risco de perda gestacional associado a esses procedimentos é de 0,1 a 0,3% em centros com experiência — um número muito menor do que muitas pacientes imaginam.

A escolha entre BVC e amniocentese depende da idade gestacional e da indicação clínica. O seu médico orientará qual é o mais adequado para o seu caso.

Em breve: Publicaremos artigos dedicados a cada procedimento — amniocentese e biópsia de vilo corial — com detalhes sobre preparo, como é feito e o que esperar.

Saiba mais sobre cirurgia fetal: quando é indicada — porque a investigação genética pode mudar completamente a conduta durante a gestação.

A genética está mudando rápido — o papel do geneticista

A cada ano, novos genes são descritos, novas doenças são reconhecidas e nosso entendimento sobre o genoma humano avança. Isso tem uma consequência prática importante: uma variante genética classificada como “incerta” (VUS) hoje pode ser reclassificada como patogênica (causadora de doença) ou benigna (normal) amanhã, à medida que novos estudos são publicados.

O médico geneticista é o profissional especificamente treinado para interpretar resultados genéticos complexos e orientar famílias sobre o significado dos achados. Na medicina fetal, o trabalho em equipe é fundamental: o especialista em medicina fetal cuida da avaliação por ultrassom e dos procedimentos, enquanto o geneticista cuida da interpretação dos resultados e do aconselhamento genético.

Um conceito que merece atenção especial é o de VUS (variante de significado incerto) — também chamada de VOUS em alguns contextos. Quando um teste genético, especialmente o exoma, encontra uma alteração no DNA, nem sempre é possível dizer com certeza se ela causa doença ou se é uma variação normal entre as pessoas. Essa incerteza é chamada de VUS.

Isso acontece com mais frequência do que se imagina. E pode gerar muita ansiedade nas famílias. O acompanhamento longitudinal (ao longo do tempo) e a reanálise periódica dos dados são estratégias fundamentais para lidar com essas situações.

Fique tranquila: Se o resultado do seu teste genético trouxe uma “variante de significado incerto” (VUS), não entre em pânico. Isso não significa que algo está errado — significa que a ciência ainda não tem certeza sobre aquela alteração específica. O geneticista é o profissional que vai contextualizar esse achado para a sua família.

Perguntas frequentes sobre testes genéticos na gestação

NIPT substitui o ultrassom morfológico?

Não. São exames complementares. O NIPT analisa o DNA — rastreia cromossomopatias e algumas microdeleções. O morfológico avalia a anatomia do bebê — detecta malformações estruturais como problemas no coração, no cérebro ou nos rins. Um não substitui o outro.
Se o NIPT deu baixo risco, preciso fazer amniocentese?

Na maioria dos casos, não. O NIPT com resultado de baixo risco é muito tranquilizador. Mas existem situações em que a amniocentese pode ser indicada mesmo com NIPT normal — por exemplo, quando o ultrassom mostra uma malformação que pode ter causa genética não detectada pelo NIPT, como uma cardiopatia ou uma displasia esquelética.
Cariótipo normal significa que o bebê não tem doença genética?

Não necessariamente. O cariótipo detecta alterações grandes nos cromossomos, mas não detecta microdeleções, mutações pontuais nem doenças monogênicas. Um cariótipo normal não exclui todas as causas genéticas. Por isso, em muitos casos — especialmente quando há malformações no ultrassom —, o microarray ou o exoma são necessários como complemento.
O que é uma variante de significado incerto (VUS)?

É uma alteração encontrada no DNA que ainda não foi classificada pela ciência como causadora de doença (patogênica) nem como normal (benigna). Isso acontece porque nosso conhecimento sobre o genoma ainda está em construção. Com o tempo, muitas VUS são reclassificadas à medida que novos estudos são publicados. O geneticista é o profissional que orienta sobre o significado e o acompanhamento adequado.
Microarray é melhor que cariótipo?

Para a maioria das indicações em medicina fetal, sim. O microarray detecta tudo que o cariótipo detecta, mais as microdeleções e microduplicações. Mas há exceções importantes: o cariótipo é superior para detectar triploidia e translocações balanceadas. Por isso, a escolha depende do contexto clínico — e em muitos centros, os dois são solicitados de forma complementar.
O exoma detecta síndrome de Down?

O exoma não é o teste indicado para diagnosticar síndrome de Down. A trissomia do 21 é uma alteração cromossômica — um cromossomo inteiro a mais —, detectada pelo cariótipo, pelo microarray ou pelo NIPT. O exoma é indicado para doenças causadas por mutações em genes específicos, como displasias esqueléticas, síndrome de Noonan ou erros inatos do metabolismo.
Qual teste genético o convênio cobre?

No Brasil, os convênios são obrigados a cobrir o cariótipo quando há indicação médica documentada. O NIPT, o microarray e o exoma geralmente não têm cobertura obrigatória, embora alguns planos cubram em situações específicas — como alto risco identificado no rastreamento ou malformações confirmadas no ultrassom. Essa realidade está mudando gradualmente. Consulte o seu convênio e seu médico sobre as opções disponíveis para o seu caso.

Referências

  1. Wapner RJ, Martin CL, Levy B, et al. Chromosomal microarray versus karyotyping for prenatal diagnosis. N Engl J Med. 2012;367(23):2175-2184.
  2. Lord J, McMullan DJ, Eberhardt RY, et al. Prenatal exome sequencing analysis in fetal structural anomalies detected by ultrasonography (PAGE): a cohort study. Lancet. 2019;393(10173):747-757.
  3. American College of Obstetricians and Gynecologists. Committee Opinion No. 581: The use of chromosomal microarray analysis in prenatal diagnosis. Obstet Gynecol. 2013;122(6):1374-1377.
  4. Gil MM, Accurti V, Santacruz B, Plana MN, Nicolaides KH. Analysis of cell-free DNA in maternal blood in screening for aneuploidies: updated meta-analysis. Ultrasound Obstet Gynecol. 2017;50(3):302-314.
  5. Richards S, Aziz N, Bale S, et al. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the ACMG and AMP. Genet Med. 2015;17(5):405-424.
  6. Petrovski S, Aggarwal V, Giordano JL, et al. Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study. Lancet. 2019;393(10173):758-767.

Dr. Rafael Frederico Bruns

Dr. Rafael Frederico Bruns

Ginecologia e Obstetrícia
Medicina Fetal

Especialista em Medicina Fetal e Cirurgia Fetal. Doutor pela UNIFESP. Professor Associado do Departamento de Tocoginecologia da UFPR. Certificado pela Fetal Medicine Foundation (FMF) de Londres.

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